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Transcriptome Analysis

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Whole transcriptome seq. & analysis

Overview

Whole transcriptome seq. & analysis는 샘플의 RNA 컨텐츠에 대한 정보를 얻기 위한 목적으로 사용되는 cDNA의 염기 서열에 대한 high-throughput sequencing 기술을 의미하며, 암과 같은 질병 연구에 적용되어 왔습니다. 차세대 시퀀싱은 깊은 범위 (deep coverage)와 단일 염기 수준의 (base-level) 해상도를 갖고 있어서, 특정 조건에서 다르게 작용하는 유전자들이나 대립 유전자들의 발현에 대한 정보를 얻을 수 있습니다. 그뿐만 아니라 단백질로 번역되지 않는 기능성 RNA(non-coding RNA) 또는 전사 후 돌연변이와 수정, 유전자 융합에 대한 정보를 얻을 수 있습니다.

Workflow

Characteristics

STRENGTH
마이크로 어레이 대비 높은 감도
단일 염기 단위의 높은 해상도
생물체에 대한 선배경지식이 없어도 가능
OPPORTUNITY
차등 발현 유전자 연구
차등 발현 대립 유전자 연구
비번역 RNA 연구
전사후 돌연변이∙수정 연구
유전자 융합 연구

mRNA seq. & analysis

Overview

mRNA seq. & analysis는 샘플의 RNA 컨텐츠에 대한 정보를 얻기 위한 목적으로 사용되는 cDNA의 염기서열에 대한
high-throughput sequencing 기술을 의미하며, 암과 같은 질병 연구에 적용되어 왔습니다. 차세대 시퀀싱은 깊은 범위
(deep coverage)와 단일 염기 수준의 (base-level) 해상도를 갖고 있어서, 특정 조건에서 다르게 작용하는 유전자들이나
대립 유전자 그리고 다르게 스플라이싱된 전사체 (differentially spliced transcripts)의 발현에 대한 정보를 얻을 수
있습니다.

Workflow

Characteristics

STRENGTH
마이크로 어레이 대비 높은 감도
단일 염기 단위의 높은 해상도
생물체에 대한 선배경지식이 없어도 가능
다양한 종류의 분석 가능
OPPORTUNITY
차등 발현 유전자 연구
차등 발현 대립 유전자 연구
차등 스플라이싱 전사체 연구
비번역 RNA 연구
전사후 돌연변이∙수정 연구
유전자 융합 연구

smallRNA seq. & analysis

Overview

smallRNA seq. & analysis는 주로 대상이 작은 RNA라는 점에서 RNA 시퀀싱의 다른 형태들과 비교가 됩니다. 기존에
밝혀진 smallRNA의 조직 특이적인 발현 양상, 질병 연관성, 이형형태 (isoform)를 연구할 수 있게 되었고, 밝혀지지 않은
새로운 smallRNA를 찾을 수 있게 되었습니다. 암과 같은 질병에서 생물체의 활동적 수준이나 화학적 수준의 비정상 기능
을 발생시키는 마이크로 RNA에 대한 연구를 통하여 미래에 질병의 진단과 예측을 위한 중요한 도구가 될 가능성을 제시
하고 있습니다.

Workflow

Characteristics

STRENGTH
마이크로 어레이 대비 높은 감도
단일 염기 단위의 높은 해상도
전 유전체적 접근이 가능
OPPORTUNITY
smallRNA의 조직 특이적 발현 패턴 연구
smallRNA의 질병 연관성 연구
smallRNA 아형 연구
새로운 smallRNA 탐색
질병에서 비정상 기능을 발생시키는 smallRNA에 대한
연구

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