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Epigenome Analysis

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Methylome seq. & analysis

Overview

에피지놈이란 DNA의 염기서열이 변화 없이 DNA메틸화, 히스톤의 변형에 의해 조절되는 유전자 발현을 연구하는 분야
입니다. 이러한 에피지놈 기전의 이해와 조절을 통해 암이나 다양한 질병 등 비정상적 유전자 발현을 밝혀내고 진단과
치료를 위한 신약개발의 기반을 마련할 수 있습니다.

AMeDIP (Methylated DNA immunoprecipitation)
5-methylcytosine (5mC) 특이적 antibody를 이용한 면역침강 반응을 통해 methylated DNA만
선택적으로 sequencing하는 방법입니다.
BMBD (Methyl-CpG Binding domain protein)
methyl-CpG-binding domain (MBD) 단백질을 이용하여 선택적으로 methyl-CpG를 회수하여
sequencing하는 방법입니다

Workflow

Characteristics

STRENGTH
기존 bisulfide sequencing에 비해 저렴한 비용
NGS를 이용한 고해상도의 정보
DNA 메틸화 등에 의해 조절되는 유전자 발현 연구
OPPORTUNITY
Methylome map을 구축
Epigenome과 암 발병, 세포 노화 등 생명현상과의 관계 규명
특정 질병이나 암을 조기 진단하는 biomarker의 확립

ChIP seq. & analysis

Overview

에피지놈이란 DNA의 염기서열이 변화 없이 DNA메틸화, 히스톤의 변형에 의해 조절되는 유전자 발현을 연구하는 분야
입니다. 이러한 에피지놈 기전의 이해와 조절을 통해 암이나 다양한 질병 등 비정상적 유전자 발현을 밝혀내고 진단과
치료를 위한 신약개발의 기반을 마련할 수 있습니다.

AChIP sequencing (Chromatin immunoprecipitation)
Transcription factor, chromatin-associated binding protein들이 결합한 DNA부위 또는 modification
부위에 특이적인 antibody를 이용한 면역침강반응을 통하여 특정 부위만 분석하는 방법입니다.

Workflow

STRENGTH
NGS를 이용한 고해상도의 정보
크로마틴 구조의 변형 등 기작 연구 가능
OPPORTUNITY
Methylome map을 구축
DNA-associated 단백질의 binding site에 대한 map을 구축
Epigenome과 암 발병, 세포 노화 등 생명현상과의 관계 규명
특정 질병이나 암을 조기 진단하는 biomarker의 확립

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