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Metagenome Analysis

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Metagenome community analysis

Overview

미생물들은 다양한 환경조건에서 군집을 이루며 동종간 또는 이종간에 상호작용을 통해 살아가기 때문에 배양이 불가능한 미생물과 더불어 단일 개체가 아닌 군집 수준의 미생물에 대한 연구와 같은 거시적인 관점에서의 연구가 미생물에 대한 올바를 이해와 활용을 위해 필요합니다. Metagenome community analysis는 미생물의 배양 없이 채취한 환경샘플에서 전체 DNA를 추출하고, NGS 기술을 이용하여 유전정보를 획득하는 방법으로 커뮤니티 분석을 통해 미생물에 대한 이해를 높이고 풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수 있는 방법으로 각광받게 되었습니다.

Workflow

Characteristics

STRENGTH
배양불가 미생물 분석
새로운 생물정보 획득
군집 내 커뮤니티 분석 가능
OPPORTUNITY
질병관련 미생물 군집 분석 및 유전자 분리, 기능 규명
샘플 내 viral community분석
인간의 장내 미생물 군집 분석
신규 미생물, 고세균 등의 분리 및 분류

Metagenome assembly

Overview

Metagenome assembly는 미생물 배양없이 획득한 커뮤니티 내 각각의 population 또는 isolate에 대한 분석으로
whole genome sequencing, de novo assembly 등을 통해 유전 정보를 분석합니다. 이를 통해 미생물에 대한 이해를
높이고 풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수 있는 방법으로 각광받게 되었습니다.

Workflow

Characteristics

STRENGTH
배양불가 미생물 분석
참조유전체서열 불필요
유용 유전자원 확보 가능
OPPORTUNITY
질병관련 미생물 군집 분석 및 유전자 분리, 기능 규명
유전 질병 예측 및 진단
미생물 군집들의 집단 특이적 유전체 분석
신규 미생물, 고세균 등의 분리 및 분류
유용 유전자 발굴

Metatranscriptome analysis

Overview

Metatranscriptome analysis는 샘플에서 얻은 군집 내에서 발현되는 유전자와 특정 처리에 따른 유전자 발현 차이를 분석하는 방법으로 전사조절기작과 조절 네트워크에 대한 이해를 통해 다양한 환경의 미생물에 대한 유용 유전자 및 질병 치료, 생태 환경 개선에 효율적으로 활용 할 수 있습니다. 이를 통해 미생물에 대한 이해를 높이고 풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수 있는 방법으로 각광받게 되었습니다.

Workflow

Characteristics

STRENGTH
배양불가 미생물 분석
유용 유전자 확보
질병 및 생태환경에 대한 개선
OPPORTUNITY
다양한 환경 내 미생물들의 전자조절기작을 통한 유전자
발현 연구
농업미생물의 전사조절 네트워크 분석을 통한 생산성,
질병저항성관련 유용유전자 확보
환경 내 미생물들의 전자조절기작 연구를 통한 환경 및
생태개선

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