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ChIP Sequencing

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ChIP Sequencing

Overview

염색질 면역침강법 (ChIP)을 이용하여 단백질과 결합된 DNA 절편을 분리한 후, 차세대염기서열분석 (NGS)을 통한 시퀀싱을 진행하는 기술로서, 최근 유전자 조절 및 후성유전체 (Epigenomics) 연구 분야에서 각광받고 있는 새로운 분석 기법입니다. 유전체의 전 범위에 걸쳐서 특정 단백질이 결합하는 위치와 해당 염기서열을 확인할 수 있으므로 DNA와 조절단백질간의 다양한 상호작용을 분석할 수 있는 매우 효율적인 기술입니다.

Workflow

A.차세대 염기서열 분석과정/B.염기서열 조립 과정/C.유전자 및 구조 분석 및 참조유전체 서열 완성과정

Characteristics

STRENGTH
모든 종류의 유기체에서 DNA 결합 단백질, 히스톤 변형 (Histon Modification), 전사인자 (Transcription Factor)
에 대한 DNA의 타겟 부위를 식별하고 매핑
DNA와 단백질의 상호작용을 전장 유전체 수준에서 분석가능
해상도와 정밀도가 높고 유전체에 대한 커버율이 높은
많은 양의 정보를 제공
단백질의 DNA와 결합 강도에 따른 특이성의 정량 분석 범위 넓음
비교적 적은 비용에 소량의 샘플을 요구
OPPORTUNITY
염색질과 결합한 단백질이 유전자의 발현 조절에 영향하는 메커니즘 연구
유전체 전 범위의 히스톤 변형 (Histone Modification) 프로파일링
전사인자 (Transcription Factor)의 결합 부위 관련 연구
DNA와 단백질 간의 상호작용 연구
형질전환 연구
동식물 영양유전체 연구
질병 진단 치료 관련 후성유전 바이오마커 개발
암 세포 연구
노화 관련 후성유전체 연구

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